More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0339 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  99.79 
 
 		 471 aa  924    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  90.79 
 
 		 470 aa  844    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  100 
 
 		 471 aa  927    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  59.51 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  51.44 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  52.52 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  54.5 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  52.02 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  51.67 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  46.57 
 
 		 477 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  43.05 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  40.75 
 
 		 467 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  42.83 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  42.6 
 
 		 472 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  40.08 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  39.7 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  39.51 
 
 		 463 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  36.24 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  37.02 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  37.73 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  36.91 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  40.77 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  40.77 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  40.9 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  40.77 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  40.9 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  40.35 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  39.64 
 
 		 460 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  39.83 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  40.41 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  38.32 
 
 		 456 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  37.85 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  37.89 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  38.39 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  38.94 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  38.94 
 
 		 451 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  37.53 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  38.19 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 470 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  36.05 
 
 		 464 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  35.89 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  35.89 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  35.89 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  35.89 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  35.89 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  35.89 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  35.89 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  36.6 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  35.08 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  36.02 
 
 		 461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35.31 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  34.09 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  33.94 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.16 
 
 		 460 aa  226  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  34.44 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  35.08 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  34.8 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  33.48 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  31.29 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.2 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.51 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  33.84 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 486 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  29.82 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  34.21 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  29.98 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  31.66 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  31.7 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  31.7 
 
 		 453 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 460 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  30.89 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  31.88 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  28.79 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.07 
 
 		 457 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 459 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  29.37 
 
 		 456 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.2 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.2 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  31.19 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2428  multidrug resistance protein NorM, putative  28.9 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00757728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>