More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2428 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2428  multidrug resistance protein NorM, putative  100 
 
 		 446 aa  880    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00757728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  32.27 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  30.61 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  28.9 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  28.9 
 
 		 471 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  30.12 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 451 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  30.32 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  29.6 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 458 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  26.08 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  28.22 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  27.7 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  28.89 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  27.23 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 453 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 453 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 453 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  26.74 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  29.55 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  27.15 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2247  Na+-driven multidrug efflux pump  26.9 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  26.17 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  30.65 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  28.22 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  26.97 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  26.28 
 
 		 452 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  26.4 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  29.56 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  26.52 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  28.22 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  27.07 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  26.38 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  25.8 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  26.68 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  26.67 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  26.78 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  28.12 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  28.57 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  25.17 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  26.7 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  26.47 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  25.78 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  27.9 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  27.9 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  27.88 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  27.9 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  27.9 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  26.47 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  26.47 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  27.9 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  24.88 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  26.7 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  25.78 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  27.9 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  26.62 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  26.53 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 477 aa  144  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  24.53 
 
 		 425 aa  143  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2909  multidrug efflux protein  27.07 
 
 		 449 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  25.78 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 486 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  25.78 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  26.37 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  25.56 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  26.67 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  26.67 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>