More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0028 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  100 
 
 
208 aa  423  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  99.04 
 
 
208 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  98.56 
 
 
208 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  98.56 
 
 
208 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  98.56 
 
 
208 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  98.56 
 
 
208 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  98.56 
 
 
208 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  95.67 
 
 
208 aa  410  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  95.19 
 
 
208 aa  410  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  95.67 
 
 
208 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  85.58 
 
 
208 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  54.59 
 
 
210 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  55.07 
 
 
214 aa  253  2e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  51.2 
 
 
213 aa  224  5e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  50.48 
 
 
213 aa  224  5e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  50.24 
 
 
211 aa  219  2e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  49.76 
 
 
209 aa  210  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  50.24 
 
 
213 aa  204  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  52.76 
 
 
205 aa  203  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  52.76 
 
 
205 aa  203  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  44.23 
 
 
211 aa  201  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  49.25 
 
 
203 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  46.15 
 
 
217 aa  191  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.6403e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  42.72 
 
 
207 aa  174  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22791e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.22 
 
 
207 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.48 
 
 
203 aa  174  1e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.59 
 
 
210 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  42.36 
 
 
209 aa  167  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.77122e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  41.35 
 
 
216 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  43.75 
 
 
205 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.11 
 
 
233 aa  165  6e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.2842e-09 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.78 
 
 
216 aa  164  1e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.06 
 
 
207 aa  164  1e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  42.03 
 
 
206 aa  162  4e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  39.22 
 
 
213 aa  162  5e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.9 
 
 
219 aa  161  5e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.86 
 
 
213 aa  160  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.33636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  41.54 
 
 
217 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  39.39 
 
 
671 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.39 
 
 
206 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  38.76 
 
 
219 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.63 
 
 
213 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  40.67 
 
 
224 aa  155  5e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  40.95 
 
 
212 aa  155  5e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.58 
 
 
214 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.13 
 
 
686 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  42.23 
 
 
208 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  40.69 
 
 
211 aa  153  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  36.16 
 
 
234 aa  152  3e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  39.21 
 
 
236 aa  152  3e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.63063e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  43.94 
 
 
707 aa  151  6e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  39.9 
 
 
205 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  42.5 
 
 
202 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  39.05 
 
 
225 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.2 
 
 
232 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.81 
 
 
686 aa  147  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  40.4 
 
 
224 aa  147  1e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  37.86 
 
 
207 aa  147  1e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.02 
 
 
234 aa  147  1e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  39.32 
 
 
703 aa  147  2e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  40.43 
 
 
211 aa  147  2e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.98 
 
 
204 aa  146  2e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  37.98 
 
 
216 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.35 
 
 
705 aa  145  4e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  36.95 
 
 
225 aa  145  4e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.75 
 
 
211 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.3 
 
 
688 aa  145  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  38.57 
 
 
217 aa  144  8e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  36.95 
 
 
209 aa  144  8e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  38.14 
 
 
226 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  40.7 
 
 
210 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  40.58 
 
 
210 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  38.46 
 
 
213 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  40.7 
 
 
210 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  34.29 
 
 
211 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  39.07 
 
 
229 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  37.38 
 
 
210 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  39.02 
 
 
214 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41.15 
 
 
207 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.36 
 
 
221 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  37.98 
 
 
218 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  38.83 
 
 
236 aa  140  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  38.38 
 
 
218 aa  140  1e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  33.8 
 
 
222 aa  140  1e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  37.63 
 
 
222 aa  140  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  37.19 
 
 
212 aa  140  1e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  35.61 
 
 
203 aa  139  2e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  42.41 
 
 
225 aa  140  2e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  39.3 
 
 
197 aa  139  2e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  37.85 
 
 
226 aa  140  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  36.89 
 
 
209 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  38.12 
 
 
226 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  39.59 
 
 
222 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  38.05 
 
 
214 aa  139  4e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  40.87 
 
 
210 aa  139  4e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  40.29 
 
 
225 aa  138  4e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.61 
 
 
211 aa  138  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  34.93 
 
 
215 aa  138  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  34.95 
 
 
901 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  40.21 
 
 
226 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>