234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0773 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  59.84 
 
 		 250 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  56.4 
 
 		 250 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  54.8 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  42.51 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  36.64 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  35.15 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  37.67 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  37.71 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  37.71 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  36.02 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  34.89 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  36.06 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  34.78 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  37.4 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  29.79 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  32.14 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  30.77 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  30.93 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  30.87 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.5 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  27.98 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  27.03 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  28.78 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  26.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  26.18 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  30.81 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  30.33 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  27.39 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  26.45 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  28.33 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  28.7 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.46 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  26.52 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  25.96 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  23.4 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.41 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  25.49 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  22.79 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  26.64 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  26.15 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  23.38 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  25.43 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2627  flagellar biosynthetic protein FliR  25.98 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  23.81 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  25.88 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  23.47 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  24.58 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  23.46 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  24.45 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  24.76 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  26.23 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  24.27 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  24.45 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  26.43 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  23.71 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  24.57 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  24.57 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  24.57 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  24.57 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  24.77 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  21.15 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  24.14 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  26.27 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  24.56 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  24.02 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  22.69 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  22.31 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25.42 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  26.87 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  23.5 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  25.94 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0010  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  24.36 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  23.36 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  25.96 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  24.09 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  24.09 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  25.35 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  23.83 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>