284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1596 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  37.65 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  35.43 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.92 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 224 aa  96.3  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  28.74 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  33.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 208 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  30.56 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.87 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  30.43 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  28.87 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.88 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>