More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0448 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  100 
 
 
825 aa  1703    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  49.06 
 
 
1136 aa  779    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  44.68 
 
 
640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  41.73 
 
 
899 aa  475  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  41.28 
 
 
843 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  42.19 
 
 
843 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  39.77 
 
 
2638 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  38.52 
 
 
712 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  38.24 
 
 
713 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  38.24 
 
 
713 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  38.24 
 
 
713 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  38.3 
 
 
713 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  37.08 
 
 
1043 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  38.24 
 
 
713 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  39.8 
 
 
842 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  38.39 
 
 
848 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  38.67 
 
 
852 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  37.99 
 
 
713 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  40.13 
 
 
655 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  37.63 
 
 
713 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  37.54 
 
 
713 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  37.94 
 
 
713 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  38.37 
 
 
852 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  37.48 
 
 
713 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  38.52 
 
 
852 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  38.52 
 
 
850 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  38.52 
 
 
852 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  40.26 
 
 
841 aa  416  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  39.9 
 
 
655 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  38.25 
 
 
856 aa  412  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  38.63 
 
 
848 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  37.35 
 
 
852 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  38.31 
 
 
874 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  37.44 
 
 
852 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  38.71 
 
 
647 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  39.57 
 
 
1064 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  39.62 
 
 
1064 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  38.45 
 
 
928 aa  385  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  35.89 
 
 
718 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  35.82 
 
 
601 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.61 
 
 
1888 aa  371  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  39.43 
 
 
640 aa  363  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.28 
 
 
669 aa  308  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  34.06 
 
 
766 aa  302  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.38 
 
 
1117 aa  286  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.16 
 
 
1176 aa  284  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.15 
 
 
891 aa  276  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.16 
 
 
1855 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.15 
 
 
991 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  30.57 
 
 
1062 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.07 
 
 
1035 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.13 
 
 
1942 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  32.99 
 
 
1441 aa  246  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  30.38 
 
 
776 aa  245  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.3 
 
 
1331 aa  243  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  29.68 
 
 
1252 aa  239  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.4 
 
 
2156 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  29.32 
 
 
1328 aa  235  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  28.15 
 
 
1432 aa  235  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.09 
 
 
946 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 
1891 aa  234  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.16 
 
 
1440 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.16 
 
 
1440 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.67 
 
 
1025 aa  232  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  31.01 
 
 
1472 aa  230  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.14 
 
 
1450 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  30.13 
 
 
1329 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.55 
 
 
1975 aa  227  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.26 
 
 
1248 aa  225  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.48 
 
 
2068 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  31.14 
 
 
1429 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  32.3 
 
 
998 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  25.17 
 
 
817 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  26.82 
 
 
696 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  26.88 
 
 
705 aa  190  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  26.96 
 
 
694 aa  188  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  25.35 
 
 
706 aa  187  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.35 
 
 
1124 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  26.73 
 
 
693 aa  184  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  28.12 
 
 
695 aa  184  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  27.65 
 
 
721 aa  183  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.55 
 
 
729 aa  183  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  29.48 
 
 
706 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  26.61 
 
 
708 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  26.9 
 
 
711 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  26.73 
 
 
711 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  27.16 
 
 
776 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  27.6 
 
 
712 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  26.79 
 
 
1537 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  27.08 
 
 
701 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  26.49 
 
 
718 aa  178  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  27.06 
 
 
706 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  27.09 
 
 
694 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  27.09 
 
 
694 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  27.8 
 
 
709 aa  176  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  26 
 
 
709 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  26.66 
 
 
707 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  26.31 
 
 
703 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  25.85 
 
 
707 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  28.35 
 
 
774 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>