More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3394 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  100 
 
 		 394 aa  767    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  82.74 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.09 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  33.5 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 		 392 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.67 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.69 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.6 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  34.04 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  34.04 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  33.78 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.95 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  32.37 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  32.66 
 
 		 397 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  33.25 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  36.68 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  39.46 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  31.98 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  33.42 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  33.6 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  33.42 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  36.27 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.89 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  32.34 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  29.9 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  34.67 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  29.35 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  31 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.96 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.53 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.42 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.73 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.75 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.36 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  31.49 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  31.49 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.98 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  36.84 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.95 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  28.12 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  35.91 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  33.14 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.4 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  35.71 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  30.43 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.34 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.85 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  32.45 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  30.41 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.2 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  33.5 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  34.86 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.95 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  30.34 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  34.86 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  32.56 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.27 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.34 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.1 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  32.76 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.1 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.72 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.43 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  34.36 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.49 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  35.15 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  33.94 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  32.76 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  32.76 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  33.53 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  33.53 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.26 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  33.53 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  31.21 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  33.92 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  32.61 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  31.77 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  34.94 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  32.53 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.97 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.53 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  31.22 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.36 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  32.53 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  31.22 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.75 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  35.62 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  32.53 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.81 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  31.43 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  33.53 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.74 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  31.76 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>