More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1089 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  879    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  89.31 
 
 		 450 aa  798    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  62.75 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 399 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 399 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  30.58 
 
 		 399 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  30.43 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 398 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 399 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.82 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  33.49 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 451 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.44 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 434 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 445 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.57 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.32 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.06 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 		 454 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.77 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  33.01 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.73 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 459 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 472 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  32.5 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.51 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  30.02 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  30.79 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  27.92 
 
 		 452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.52 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 474 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.74 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.7 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.7 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  29.27 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.21 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.9 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.31 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>