More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4699 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.21 
 
 		 6768 aa  1107    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  52.63 
 
 		 2376 aa  898    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  54.49 
 
 		 3463 aa  2327    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.03 
 
 		 1602 aa  1133    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  52.09 
 
 		 1584 aa  791    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  46.63 
 
 		 1831 aa  1211    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.08 
 
 		 3355 aa  1788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.89 
 
 		 3033 aa  1024    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  41.45 
 
 		 2719 aa  1208    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.46 
 
 		 2066 aa  1182    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.78 
 
 		 3645 aa  1358    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.93 
 
 		 2462 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  48.84 
 
 		 1143 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  34.97 
 
 		 5526 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.82 
 
 		 4607 aa  890    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  51.49 
 
 		 3494 aa  2175    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.4 
 
 		 2551 aa  753    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 1874 aa  924    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.74 
 
 		 1656 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.49 
 
 		 1372 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.39 
 
 		 1587 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  50.58 
 
 		 5154 aa  2140    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 		 2232 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  47.45 
 
 		 3400 aa  730    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  52.47 
 
 		 1601 aa  780    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  48.89 
 
 		 4840 aa  1399    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.1 
 
 		 3252 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  100 
 
 		 4080 aa  7876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.51 
 
 		 3254 aa  1169    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  42.81 
 
 		 1349 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  41.55 
 
 		 1559 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  52.61 
 
 		 2081 aa  944    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.87 
 
 		 3111 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.46 
 
 		 3670 aa  1308    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.33 
 
 		 5255 aa  2055    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  52.66 
 
 		 2966 aa  1816    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.61 
 
 		 2126 aa  1035    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 		 7110 aa  2412    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 		 3693 aa  820    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45 
 
 		 1402 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.54 
 
 		 1337 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.78 
 
 		 1816 aa  1505    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.3 
 
 		 7279 aa  2417    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  45.46 
 
 		 3930 aa  1352    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.22 
 
 		 1559 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.98 
 
 		 3158 aa  992    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  46.2 
 
 		 4930 aa  1215    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.21 
 
 		 2551 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  40.3 
 
 		 4183 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.48 
 
 		 1354 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  49.95 
 
 		 2024 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 		 3874 aa  1343    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  52.06 
 
 		 7210 aa  2422    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.51 
 
 		 1966 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.71 
 
 		 1924 aa  1148    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  47.18 
 
 		 3148 aa  1404    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.48 
 
 		 4478 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  54.23 
 
 		 3711 aa  2346    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.5 
 
 		 4575 aa  1215    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  52.27 
 
 		 2367 aa  1165    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 		 3693 aa  820    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.25 
 
 		 3408 aa  2083    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.41 
 
 		 3092 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 2762 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.63 
 
 		 3508 aa  1838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.95 
 
 		 1867 aa  1280    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.59 
 
 		 2846 aa  1592    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.11 
 
 		 2880 aa  758    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  41.88 
 
 		 3676 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.92 
 
 		 1349 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.31 
 
 		 3696 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  52.29 
 
 		 1593 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 1805 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  50.86 
 
 		 2847 aa  1721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.09 
 
 		 3176 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.26 
 
 		 5400 aa  2555    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  49.97 
 
 		 2107 aa  1238    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  54.72 
 
 		 1071 aa  807    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 2333 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 		 1939 aa  784    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.49 
 
 		 2890 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  37.84 
 
 		 2604 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  49.94 
 
 		 1114 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 		 2230 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.97 
 
 		 3702 aa  820    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.56 
 
 		 2060 aa  987    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  40.29 
 
 		 1087 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  59.03 
 
 		 1548 aa  938    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  43.07 
 
 		 3449 aa  1176    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  50.14 
 
 		 2113 aa  1319    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  49.11 
 
 		 3493 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.42 
 
 		 4151 aa  1232    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.81 
 
 		 1804 aa  737    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.18 
 
 		 3679 aa  788    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  53.55 
 
 		 2374 aa  927    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  45.43 
 
 		 4111 aa  1815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.67 
 
 		 1820 aa  1193    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.13 
 
 		 1837 aa  1174    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  47.13 
 
 		 1789 aa  1285    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  44.87 
 
 		 2090 aa  1168    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>