More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2790 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  62.34 
 
 		 738 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  68.04 
 
 		 734 aa  860    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 729 aa  1414    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  72.97 
 
 		 726 aa  852    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  62.6 
 
 		 726 aa  634  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  49.86 
 
 		 728 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  51.32 
 
 		 723 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  50 
 
 		 734 aa  588  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  49.39 
 
 		 731 aa  558  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  49.24 
 
 		 755 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  50.07 
 
 		 1058 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  47.83 
 
 		 735 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  48.12 
 
 		 832 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  46.69 
 
 		 735 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  50.28 
 
 		 724 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  47.49 
 
 		 793 aa  522  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  46.01 
 
 		 737 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  46.92 
 
 		 734 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  46.51 
 
 		 807 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  42.17 
 
 		 920 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  46.63 
 
 		 732 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  42.78 
 
 		 779 aa  479  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  44.05 
 
 		 787 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  41.4 
 
 		 779 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  42.86 
 
 		 909 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.9 
 
 		 829 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.9 
 
 		 829 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.71 
 
 		 732 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  43.18 
 
 		 1002 aa  451  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  41.69 
 
 		 917 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  45.92 
 
 		 854 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.56 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.56 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  40.56 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  44.11 
 
 		 737 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  38.34 
 
 		 791 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  36.42 
 
 		 893 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  44.11 
 
 		 903 aa  432  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  37.69 
 
 		 704 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.72 
 
 		 1382 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.47 
 
 		 746 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  39.04 
 
 		 760 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.44 
 
 		 743 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  44.28 
 
 		 1092 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  37.04 
 
 		 742 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 735 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  39.56 
 
 		 784 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  42.74 
 
 		 903 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  39.57 
 
 		 958 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  42.63 
 
 		 843 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  41.92 
 
 		 840 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  39.08 
 
 		 787 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.81 
 
 		 717 aa  357  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.94 
 
 		 752 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.55 
 
 		 758 aa  350  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.68 
 
 		 732 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.43 
 
 		 842 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.26 
 
 		 718 aa  336  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  36.63 
 
 		 715 aa  336  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  34.33 
 
 		 876 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.42 
 
 		 726 aa  333  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.31 
 
 		 737 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.96 
 
 		 729 aa  328  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.11 
 
 		 751 aa  326  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.66 
 
 		 735 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  35.16 
 
 		 749 aa  323  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.57 
 
 		 781 aa  307  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 		 711 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.76 
 
 		 724 aa  296  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.11 
 
 		 723 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  36.21 
 
 		 836 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 740 aa  269  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.18 
 
 		 750 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.43 
 
 		 714 aa  260  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.7 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.01 
 
 		 966 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.51 
 
 		 983 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.51 
 
 		 983 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.48 
 
 		 968 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.68 
 
 		 979 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  34.01 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.36 
 
 		 978 aa  243  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.67 
 
 		 741 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.6 
 
 		 734 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.47 
 
 		 740 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.95 
 
 		 738 aa  218  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.52 
 
 		 743 aa  217  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.12 
 
 		 743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.17 
 
 		 758 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.5 
 
 		 710 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  30.82 
 
 		 717 aa  211  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  29.51 
 
 		 733 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  28.94 
 
 		 846 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  27.99 
 
 		 766 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  24.57 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  24.86 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.31 
 
 		 738 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  32.39 
 
 		 709 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  24.05 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.93 
 
 		 757 aa  197  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>