More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2680 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 601 aa  1153    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  62.48 
 
 		 584 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  48.23 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 528 aa  415  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  50.1 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.5 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  50 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 526 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 514 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 563 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  48.96 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.57 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 536 aa  359  6e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 518 aa  359  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 529 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  50.11 
 
 		 481 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 513 aa  353  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 		 496 aa  351  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 		 539 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 509 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 540 aa  336  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.4 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  42.69 
 
 		 508 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 506 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.65 
 
 		 537 aa  332  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 509 aa  330  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 519 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  42.81 
 
 		 535 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 524 aa  317  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  43.01 
 
 		 505 aa  306  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 516 aa  289  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 516 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 528 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 490 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 514 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.49 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 511 aa  273  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.84 
 
 		 492 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.55 
 
 		 525 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 510 aa  253  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.51 
 
 		 534 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  38.59 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  34.69 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  38.43 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 516 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  34.76 
 
 		 500 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 500 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.17 
 
 		 538 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 503 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  39.05 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 520 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 514 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  33.74 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  33.74 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  33.74 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  33.54 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 532 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  33.74 
 
 		 495 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 504 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 509 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 607 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 494 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.91 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.89 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 524 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 		 503 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 515 aa  203  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>