92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1930 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 500 aa  1002    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.56 
 
 		 507 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  62.91 
 
 		 506 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.52 
 
 		 504 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  61.35 
 
 		 507 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.71 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  59.38 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.08 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  60.2 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  65.87 
 
 		 507 aa  548  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  66.5 
 
 		 448 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.83 
 
 		 508 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.28 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.56 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  55.53 
 
 		 515 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.26 
 
 		 515 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.84 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.77 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  54.33 
 
 		 522 aa  511  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.6 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.1 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.3 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  55.34 
 
 		 527 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.2 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.11 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.2 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.5 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.6 
 
 		 502 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.61 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.63 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  48.53 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  46.22 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.91 
 
 		 502 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.53 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  41.85 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.31 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.31 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.2 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  34.92 
 
 		 504 aa  266  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  33 
 
 		 484 aa  263  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  33 
 
 		 484 aa  262  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  33.81 
 
 		 543 aa  236  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.96 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  31.55 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.57 
 
 		 493 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.02 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.7 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.57 
 
 		 549 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  31.36 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  28.63 
 
 		 534 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.02 
 
 		 514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.86 
 
 		 662 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.83 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.46 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  29.45 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.12 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.17 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.93 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.91 
 
 		 510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.16 
 
 		 507 aa  146  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.03 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.76 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  27.31 
 
 		 505 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.24 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.34 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.79 
 
 		 529 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.98 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.62 
 
 		 778 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.43 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.64 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.86 
 
 		 732 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.26 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.42 
 
 		 703 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  26.3 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.52 
 
 		 691 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.22 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  25.78 
 
 		 704 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.92 
 
 		 684 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  31.87 
 
 		 704 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  23.27 
 
 		 679 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  29.83 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.86 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.86 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.12 
 
 		 824 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  22.33 
 
 		 699 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.22 
 
 		 826 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  22.22 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.97 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1002 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6365  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  23.27 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.97 
 
 		 855 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  23.71 
 
 		 660 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>