More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1721 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 160 aa  310  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  39.09 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.19 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  38.21 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.82 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  42.61 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  35.03 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  40.68 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  38.21 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  41.25 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 175 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  35.19 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>