261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1790 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  100 
 
 
134 aa  259  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.68 
 
 
148 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.76 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  40.62 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  40.83 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.34 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.2 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.28 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  39.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  37.1 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  37.98 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  36.22 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  38.28 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  36.09 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  41.09 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  38.24 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  39.55 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  36.84 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  39.06 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  42.22 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.1 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  38.71 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  35 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  39.8 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  36.29 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.85 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  39.32 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.81 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  43.2 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  39.2 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  40.16 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  35.66 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  40.16 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  37.7 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  44.33 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  38.58 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  34.29 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  40 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  40 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  39.37 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  40 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  37.41 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  37.41 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  37.4 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.93 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  37.41 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  36.8 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.69 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  37.6 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  37.04 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  36.03 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  39.84 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  38.64 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  39.39 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  36.54 
 
 
198 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  42.62 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.4 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  42.7 
 
 
216 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  35.94 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  28.46 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.56 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  37.5 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  28.46 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  33.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  28.46 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  35.16 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  38.64 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  35.16 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  39.56 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  34.31 
 
 
198 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  35.97 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  32.59 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  33.09 
 
 
198 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  34.78 
 
 
197 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.58 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30.08 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.61 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.78 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  35.11 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  37.27 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  35.94 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  37.5 
 
 
204 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  37.7 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  35.2 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  37.4 
 
 
154 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  39.2 
 
 
171 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  35.92 
 
 
170 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  34.74 
 
 
202 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  36.08 
 
 
152 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  40.88 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  34.74 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  39.02 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  31.93 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>