103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1678 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 986 aa  2014    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 1041 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1075 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.34 
 
 		 979 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1075 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1167 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1125 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1069 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.5 
 
 		 966 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 1149 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 1065 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1114 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1123 aa  171  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 1232 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 1176 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 1105 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  37.42 
 
 		 1195 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1123 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  31.27 
 
 		 1203 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1122 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1161 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  32.06 
 
 		 511 aa  145  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1257 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 1153 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 1016 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  31.48 
 
 		 1210 aa  139  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  23.91 
 
 		 992 aa  137  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  24.46 
 
 		 1012 aa  137  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  31.4 
 
 		 1298 aa  134  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1196 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1162 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1206 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1008 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 1008 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1132 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 1105 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  28.97 
 
 		 1194 aa  121  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1173 aa  121  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1141 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.71 
 
 		 1162 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1053 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  22.7 
 
 		 1010 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.21 
 
 		 1068 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1067 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1052 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.62 
 
 		 1001 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1071 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1124 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1068 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1010 aa  99  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1188 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 972 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.5 
 
 		 1041 aa  96.3  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1194 aa  95.1  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1126 aa  94.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.07 
 
 		 1007 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1120 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1122 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 993 aa  93.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 1074 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1077 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1071 aa  91.3  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  21.37 
 
 		 994 aa  88.2  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  21.37 
 
 		 1125 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 1066 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1066 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 1054 aa  85.1  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1109 aa  84.7  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1074 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 991 aa  84.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  22.34 
 
 		 1097 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 1026 aa  82.8  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.33 
 
 		 1081 aa  81.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1129 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  22.47 
 
 		 1061 aa  78.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 1007 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.55 
 
 		 1051 aa  75.5  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  20.78 
 
 		 997 aa  74.7  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1007 aa  74.7  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 897 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1105 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.2 
 
 		 1050 aa  71.2  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 871 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.75 
 
 		 1037 aa  69.3  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 1116 aa  69.3  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  22.14 
 
 		 1057 aa  69.3  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 1066 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  21.8 
 
 		 1100 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.73 
 
 		 1066 aa  58.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.32 
 
 		 1056 aa  55.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  21.8 
 
 		 710 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.87 
 
 		 1008 aa  55.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 1089 aa  51.6  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 749 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 781 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 804 aa  49.3  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 924 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 952 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.83 
 
 		 707 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>