More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0606 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  42.34 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  44.7 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  38.41 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  39.46 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  39.39 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.73 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  43.82 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.96 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  41.59 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.81 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  52.86 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  34.51 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  36.19 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.85 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  42.05 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.17 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>