More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3443 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  74.77 
 
 		 439 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  100 
 
 		 436 aa  887    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  66.28 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  59.4 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.24 
 
 		 561 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.24 
 
 		 561 aa  139  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  27.79 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  26.96 
 
 		 436 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  32.27 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.12 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.12 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  36.97 
 
 		 329 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  36.53 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  32.86 
 
 		 303 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  35.47 
 
 		 312 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  32.83 
 
 		 315 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  28.72 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  31.21 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  37.42 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  29.67 
 
 		 276 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 311 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  32.72 
 
 		 310 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 274 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  23.23 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 276 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 272 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 447 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  29 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  27.88 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0284  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  26.06 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  26.8 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  30.46 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  32.88 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  28.49 
 
 		 603 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 568 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 645 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.61 
 
 		 875 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.51 
 
 		 293 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.26 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1601  hypothetical protein  30.07 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0256  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  28.31 
 
 		 575 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 622 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 203 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 265 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.38 
 
 		 668 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 596 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.53 
 
 		 927 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 		 883 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 879 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.42 
 
 		 729 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.48 
 
 		 267 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 697 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  26.78 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  26.6 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 209 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1676 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.21 
 
 		 558 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 593 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25.45 
 
 		 569 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_002950  PG1467  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.57 
 
 		 203 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.28 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 185 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 195 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  19.66 
 
 		 979 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 573 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 878 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.37 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  19.5 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 209 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 4079 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  30.39 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.63 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  30.33 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.75 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 750 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>