More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2303 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
300 aa  587  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2103  alpha/beta hydrolase fold protein  71.72 
 
 
296 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1611  alpha/beta hydrolase fold  72.07 
 
 
296 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107227  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  57.65 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2687  alpha/beta hydrolase fold  57.95 
 
 
291 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2492  alpha/beta hydrolase fold  58.22 
 
 
295 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149577  normal  0.991851 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  48.88 
 
 
313 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
298 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3218  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
290 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
284 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
276 aa  63.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
277 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.1 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.14 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.94 
 
 
367 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
248 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.21 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.5 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
352 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.53 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  27.32 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  34.17 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
262 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.85 
 
 
372 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.69 
 
 
291 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  32.23 
 
 
332 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  31.79 
 
 
334 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
312 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
306 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
251 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0532502  normal  0.345271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
277 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
333 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.93 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.73 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  27.18 
 
 
571 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  29.15 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  21.32 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
343 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>