More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1431 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  81.84 
 
 
451 aa  706  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  77.19 
 
 
452 aa  673  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  73.23 
 
 
474 aa  638  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  81.84 
 
 
451 aa  706  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  100 
 
 
471 aa  954  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  72.77 
 
 
464 aa  638  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  74.03 
 
 
471 aa  663  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  72.93 
 
 
464 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  68.48 
 
 
456 aa  582  1e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  57.36 
 
 
435 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  52.2 
 
 
447 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  53.52 
 
 
457 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  51.55 
 
 
475 aa  417  1e-115  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  50.55 
 
 
477 aa  416  1e-115  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  51.98 
 
 
447 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  57.14 
 
 
393 aa  407  1e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  46.36 
 
 
498 aa  399  1e-110  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  47.05 
 
 
503 aa  398  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  53.17 
 
 
395 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  49.34 
 
 
436 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  48.15 
 
 
399 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  48.42 
 
 
433 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  47.34 
 
 
460 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  46.56 
 
 
465 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  7.6277e-06 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  46.58 
 
 
466 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  3.21559e-05 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  47.8 
 
 
449 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  47.8 
 
 
454 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  47.8 
 
 
454 aa  338  1e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  47.68 
 
 
437 aa  338  1e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  47.68 
 
 
437 aa  338  1e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  47.68 
 
 
437 aa  338  1e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  47.68 
 
 
442 aa  337  3e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  47.57 
 
 
445 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  45.98 
 
 
462 aa  329  5e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  45.98 
 
 
462 aa  329  5e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  45.54 
 
 
434 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  46.27 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  46.13 
 
 
441 aa  322  1e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  46.38 
 
 
391 aa  319  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.87062e-07 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  45.09 
 
 
436 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  40.51 
 
 
403 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  45.18 
 
 
446 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.72 
 
 
405 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  43.79 
 
 
393 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  40.78 
 
 
407 aa  272  9e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  43.92 
 
 
413 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  41.77 
 
 
406 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  41.28 
 
 
395 aa  266  6e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  38.35 
 
 
395 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  38.86 
 
 
395 aa  255  1e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  37.63 
 
 
420 aa  254  2e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  42.57 
 
 
399 aa  254  2e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  39.84 
 
 
400 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  39.83 
 
 
393 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  39.28 
 
 
393 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.83 
 
 
386 aa  253  4e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  39.28 
 
 
405 aa  253  4e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  42.27 
 
 
400 aa  253  5e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  36.21 
 
 
379 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.08673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  38.52 
 
 
389 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  36.31 
 
 
418 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  38.86 
 
 
414 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  6.33953e-12 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  39.59 
 
 
393 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  35.54 
 
 
381 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  35.54 
 
 
381 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  35.94 
 
 
382 aa  246  7e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  35.22 
 
 
379 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.2736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  35.22 
 
 
379 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.88714e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  35.22 
 
 
379 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.65537e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  37.16 
 
 
401 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  37.19 
 
 
389 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.38 
 
 
459 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3278  HflK protein  34.15 
 
 
380 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  33.74 
 
 
386 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.94 
 
 
351 aa  236  5e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  38.84 
 
 
401 aa  236  5e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  33.82 
 
 
381 aa  236  5e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  1.31875e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  34.07 
 
 
381 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  37.99 
 
 
383 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  38.16 
 
 
407 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.62 
 
 
386 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  34.43 
 
 
386 aa  229  8e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.57 
 
 
420 aa  229  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  38.41 
 
 
378 aa  227  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3538  HflK protein  32.75 
 
 
383 aa  226  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  33.09 
 
 
380 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  37.2 
 
 
367 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.27817e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  37.63 
 
 
382 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  32.84 
 
 
377 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3236  HflK protein  34.69 
 
 
390 aa  223  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0144208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  39.07 
 
 
388 aa  221  2e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.21 
 
 
398 aa  221  2e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  34.01 
 
 
379 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.20742e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  38.03 
 
 
385 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  38.28 
 
 
344 aa  219  7e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  36.16 
 
 
421 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  40.2 
 
 
360 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0433  FtsH protease regulator HflK  38.14 
 
 
419 aa  215  2e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0562883  unclonable  3.48967e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0799  HflK protein  33.8 
 
 
381 aa  214  2e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.93 
 
 
394 aa  214  3e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>