More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2102 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 433 aa  866    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  39.44 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.89 
 
 		 752 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  41.01 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.15 
 
 		 754 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.15 
 
 		 754 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.37 
 
 		 754 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  40.32 
 
 		 413 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.15 
 
 		 754 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.15 
 
 		 754 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.37 
 
 		 754 aa  255  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.15 
 
 		 754 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  40.88 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.92 
 
 		 754 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.92 
 
 		 754 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.68 
 
 		 755 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.26 
 
 		 750 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.58 
 
 		 750 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.86 
 
 		 763 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.55 
 
 		 735 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  35.5 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  36.41 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.83 
 
 		 759 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.83 
 
 		 759 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  36.43 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  36.66 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.48 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  35.75 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  34.78 
 
 		 423 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 		 441 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  34.67 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.47 
 
 		 594 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.47 
 
 		 594 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  34.32 
 
 		 470 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.38 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  31.47 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  31.19 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  31.12 
 
 		 461 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  30.73 
 
 		 474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  31.45 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.9 
 
 		 533 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.13 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 		 470 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 		 470 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  36.94 
 
 		 524 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.17 
 
 		 533 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.06 
 
 		 848 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 530 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  35.31 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.12 
 
 		 534 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.06 
 
 		 849 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  36.44 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  31.3 
 
 		 532 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  31.5 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  32.29 
 
 		 532 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.42 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  33.51 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.7 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  34.7 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30.84 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 531 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  34.85 
 
 		 532 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  33.71 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.01 
 
 		 856 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  36.84 
 
 		 534 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  34.48 
 
 		 533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  35.33 
 
 		 533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.47 
 
 		 759 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  35.79 
 
 		 533 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  33.96 
 
 		 471 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.61 
 
 		 853 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  33.96 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  31.34 
 
 		 533 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.33 
 
 		 533 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  34.63 
 
 		 636 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  33.07 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.14 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  36.07 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 530 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  35.79 
 
 		 532 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  31.55 
 
 		 734 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.75 
 
 		 748 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.46 
 
 		 532 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31.21 
 
 		 740 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  32.8 
 
 		 533 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.92 
 
 		 531 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  33.95 
 
 		 640 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 843 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  34.36 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.95 
 
 		 844 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  37.07 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>