47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1142 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  41.89 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  37.1 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  37.1 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  37.9 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  38.81 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  36.7 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  36.36 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  38.64 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  36.71 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  41.1 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  36.87 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  39.82 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  35.29 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  38.16 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  33.18 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  32.14 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  32.09 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  31.25 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  34.71 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  28.7 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  29.65 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  34.15 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  31.72 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  34.76 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  34.26 
 
 		 290 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  32.08 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  32.2 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  32.35 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  32.68 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  32.54 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  30.46 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  29.44 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  29.44 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  30.8 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  30.81 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  30.77 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  35.24 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  30.94 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  32.55 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  32.99 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  31.07 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  31.98 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  27.86 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  26.7 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  29.84 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  27.22 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>