5688 genes were found for organism Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
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Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PSPTO_0001  CDS  NC_004578  339  1874  +  1536  chromosomal replication initiator protein DnaA  NP_789863  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0002  CDS  NC_004578  1913  3016  +  1104  DNA polymerase III, beta subunit  NP_789864  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0003  CDS  NC_004578  3039  4142  +  1104  DNA replication and repair protein RecF  NP_789865  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0004  CDS  NC_004578  4147  6564  +  2418  DNA gyrase, subunit B  NP_789866  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0005  CDS  NC_004578  7092  8798  +  1707  type I restriction-modification system, M subunit, putative  NP_789867  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0006  CDS  NC_004578  8861  10168  +  1308  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  NP_789868  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0007  CDS  NC_004578  10179  11063  +  885  hypothetical protein  NP_789869  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0008  CDS  NC_004578  11067  14366  +  3300  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  NP_789870  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0009  CDS  NC_004578  14512  15741  -  1230  ISPsy3, transposase  NP_789871  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0011  CDS  NC_004578  16743  17453  +  711  hypothetical protein  NP_789872  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0012  CDS  NC_004578  17514  18017  +  504  hypothetical protein  NP_789873  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0013  CDS  NC_004578  17992  18561  +  570  hypothetical protein  NP_789874  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0014  CDS  NC_004578  18573  18863  -  291  hypothetical protein  NP_789875  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0015  CDS  NC_004578  19321  19932  +  612  hypothetical protein  NP_789876  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0016  CDS  NC_004578  19968  20435  +  468  hypothetical protein  NP_789877  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0017  CDS  NC_004578  20738  23143  -  2406  helicase/SNF2 family domain protein  NP_789878  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0018  CDS  NC_004578  23290  24099  -  810  ISPsy4, transposition helper protein  NP_789879  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0019  CDS  NC_004578  24096  25118  -  1023  ISPsy4, transposase  NP_789880  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0020  CDS  NC_004578  25187  25537  -  351  hypothetical protein  NP_789881  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0021  CDS  NC_004578  25556  27796  -  2241  hypothetical protein  NP_789882  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0022  CDS  NC_004578  28478  29323  +  846  DNA-binding protein  NP_789883  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0023  CDS  NC_004578  29320  29919  +  600  hypothetical protein  NP_789884  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0024  CDS  NC_004578  30850  30987  +  138  hypothetical protein  NP_789885  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0025  CDS  NC_004578  31338  31967  +  630  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  NP_789886  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0026  CDS  NC_004578  32022  33068  -  1047  hypothetical protein  NP_789887  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0027  CDS  NC_004578  33254  33976  +  723  hypothetical protein  NP_789888  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0028  CDS  NC_004578  33978  35933  +  1956  transposase  NP_789889  normal  0.680566  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0029  CDS  NC_004578  35933  36868  +  936  transposition helper protein  NP_789890  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0030  CDS  NC_004578  36881  38767  +  1887  hypothetical protein  NP_789891  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0031  CDS  NC_004578  39345  40082  +  738  Ser/Thr protein phosphatase family protein  NP_789892  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0032  CDS  NC_004578  40884  41852  -  969  hypothetical protein  NP_789893  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0033  CDS  NC_004578  41852  42757  -  906  ParB family protein  NP_789894  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0034  CDS  NC_004578  42754  44310  -  1557  recombinase, putative  NP_789895  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0035  CDS  NC_004578  45183  46736  -  1554  ISPsy5, transposase  NP_789896  normal  0.701861  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0036  CDS  NC_004578  46754  47113  -  360  ISPsy5, Orf1  NP_789897  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0037  CDS  NC_004578  47448  52358  +  4911  helicase domain protein  NP_789898  normal  0.527167  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0038  CDS  NC_004578  52403  54493  +  2091  hypothetical protein  NP_789899  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0039  CDS  NC_004578  54971  56524  -  1554  ISPsy5, transposase  NP_789900  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0040  CDS  NC_004578  56542  56901  -  360  ISPsy5, Orf1  NP_789901  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0041  CDS  NC_004578  56961  57347  +  387  hypothetical protein  NP_789902  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0042    NC_004578  57351  58214  +  864      normal  0.307918  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0043  CDS  NC_004578  58344  59906  +  1563  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  NP_789903  normal  0.0728116  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0044  CDS  NC_004578  60407  61423  -  1017  type III effector HopK1  NP_789904  normal  0.576729  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0045  CDS  NC_004578  61526  61684  +  159  hypothetical protein  NP_789905  normal  0.444895  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0046  CDS  NC_004578  62078  64063  +  1986  hypothetical protein  NP_789906  normal  0.489022  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0047  CDS  NC_004578  64066  65970  +  1905  UvrD/REP helicase family protein  NP_789907  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0048  CDS  NC_004578  67445  68611  +  1167  hypothetical protein  NP_789908  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0049  CDS  NC_004578  68863  69606  +  744  hypothetical protein  NP_789909  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0050  CDS  NC_004578  69623  70954  +  1332  hypothetical protein  NP_789910  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0051  CDS  NC_004578  71041  71484  +  444  hypothetical protein  NP_789911  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0052  CDS  NC_004578  71711  73480  +  1770  hypothetical protein  NP_789912  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0053  CDS  NC_004578  73641  75086  -  1446  hypothetical protein  NP_789913  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0054  CDS  NC_004578  75073  75684  -  612  hypothetical protein  NP_789914  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0055  CDS  NC_004578  75949  76971  +  1023  ISPsy4, transposase  NP_789915  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0056  CDS  NC_004578  76968  77777  +  810  ISPsy4, transposition helper protein  NP_789916  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0057  CDS  NC_004578  78120  79010  -  891  transposition helper protein  NP_789917  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0058  CDS  NC_004578  79007  80794  -  1788  transposase  NP_789918  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0059  CDS  NC_004578  80922  81542  -  621  hypothetical protein  NP_789919  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0060    NC_004578  81816  82382  +  567      normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0061  CDS  NC_004578  82500  83363  +  864  type III effector HopY1  NP_789920  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0062  CDS  NC_004578  83552  84859  -  1308  citrate transporter  NP_789921  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0063  CDS  NC_004578  85159  85557  +  399  hypothetical protein  NP_789922  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0064  CDS  NC_004578  85784  87181  -  1398  hypothetical protein  NP_789923  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0065  CDS  NC_004578  87268  89343  -  2076  ATP-dependent DNA helicase RecG  NP_789924  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0066  CDS  NC_004578  89355  90278  -  924  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  NP_789925  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0067  CDS  NC_004578  90371  91117  -  747  tonB protein  NP_789926  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0068  CDS  NC_004578  91114  91539  -  426  TonB system transport protein ExbD  NP_789927  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0069  CDS  NC_004578  91543  92499  -  957  TonB system transport protein ExbB  NP_789928  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0070  CDS  NC_004578  92710  93558  +  849  hypothetical protein  NP_789929  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0071  CDS  NC_004578  93607  94344  -  738  lipoprotein, putative  NP_789930  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0072  CDS  NC_004578  94399  94779  -  381  endoribonuclease L-PSP, putative  NP_789931  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0073  CDS  NC_004578  94805  96910  -  2106  guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase  NP_789932  normal  0.977893  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0074  CDS  NC_004578  96971  97234  -  264  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  NP_789933  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0075  CDS  NC_004578  97382  98026  -  645  guanylate kinase  NP_789934  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0076  CDS  NC_004578  98040  98903  -  864  hypothetical protein  NP_789935  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0077  CDS  NC_004578  99223  99945  +  723  ribonuclease PH  NP_789936  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0078  CDS  NC_004578  99962  100333  +  372  hypothetical protein  NP_789937  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0079  CDS  NC_004578  100403  101182  -  780  exodeoxyribonuclease III, putative  NP_789938  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0080  CDS  NC_004578  101265  101906  +  642  orotate phosphoribosyltransferase  NP_789939  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0081  CDS  NC_004578  101917  102549  +  633  hypothetical protein  NP_789940  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0082  CDS  NC_004578  102801  103706  -  906  acetylglutamate kinase  NP_789941  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0083  CDS  NC_004578  103735  105132  -  1398  phosphomannomutase AlgC  NP_789942  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0084  CDS  NC_004578  106375  106830  -  456  deoxyuridine 5'triphosphate nucleotidohydrolase  NP_789943  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0085  CDS  NC_004578  106837  108084  -  1248  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  NP_789944  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0086  CDS  NC_004578  108181  108855  +  675  DNA repair protein RadC  NP_789945  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0087  CDS  NC_004578  108910  110496  -  1587  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  NP_789946  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0088  CDS  NC_004578  110557  110691  -  135  hypothetical protein  NP_789947  normal  0.92589  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0089  CDS  NC_004578  110860  111093  +  234  ribosomal protein L28  NP_789948  normal  0.376703  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0090  CDS  NC_004578  111105  111260  +  156  ribosomal protein L33  NP_789949  normal  0.519895  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0091  CDS  NC_004578  111368  111733  -  366  hypothetical protein  NP_789950  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0092  CDS  NC_004578  111972  113465  +  1494  aldehyde dehydrogenase family protein  NP_789951  normal  0.769215  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0093  CDS  NC_004578  113528  113779  -  252  hypothetical protein  NP_789952  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0094  CDS  NC_004578  113892  115040  +  1149  hypothetical protein  NP_789953  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0095  CDS  NC_004578  115037  116665  -  1629  phospholipase D family protein  NP_789954  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0096  CDS  NC_004578  116690  118111  -  1422  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  NP_789955  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0097  CDS  NC_004578  118233  118538  +  306  hypothetical protein  NP_789956  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0098  CDS  NC_004578  118544  119857  -  1314  hypothetical protein  NP_789957  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0099  CDS  NC_004578  119909  120316  +  408  hypothetical protein  NP_789958  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0100  CDS  NC_004578  120331  120819  -  489  leucine-responsive regulatory protein  NP_789959  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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PSPTO_0101  CDS  NC_004578  120976  122277  +  1302  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  NP_789960  normal  1  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
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