100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0031 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
245 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  53.66 
 
 
251 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  49.19 
 
 
242 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  44.19 
 
 
279 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  41.57 
 
 
258 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  41.82 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
255 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  40.75 
 
 
258 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  40.75 
 
 
258 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  40 
 
 
277 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  41.92 
 
 
252 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  37.45 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  42.41 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  41.73 
 
 
255 aa  171  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  37.94 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  40.53 
 
 
266 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  40.39 
 
 
268 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
292 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  39.04 
 
 
261 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  37.23 
 
 
276 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  38.4 
 
 
262 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  39.84 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  39.31 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  36.98 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  37.07 
 
 
424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
276 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  37.15 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  37.97 
 
 
280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  36.68 
 
 
424 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  36.96 
 
 
247 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  38.31 
 
 
275 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  38.31 
 
 
275 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  36.4 
 
 
259 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  34.17 
 
 
282 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  34.77 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  44 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  38.04 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  37.12 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  37.12 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  35.07 
 
 
316 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
311 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  35.36 
 
 
278 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.36 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
283 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  33.95 
 
 
262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  33.7 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  30.68 
 
 
277 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  35.1 
 
 
263 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  36.44 
 
 
265 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.1 
 
 
304 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.33 
 
 
262 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  35.94 
 
 
257 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  33.59 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  28.78 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  32.28 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
262 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  32.28 
 
 
281 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.84 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
263 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  35.09 
 
 
259 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  32.14 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  35.38 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  31.95 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
265 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  31.37 
 
 
264 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  33.46 
 
 
276 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  28.23 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  33.86 
 
 
294 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  31.01 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  29.97 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
254 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.48 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  30.45 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  38.06 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  38.06 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  29.51 
 
 
605 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  24.1 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
338 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
338 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  29.24 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  31.87 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
328 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  25.75 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3584  metallophosphoesterase  23.29 
 
 
258 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0815  metallophosphoesterase  23.6 
 
 
253 aa  42  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.983977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>