102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5903 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  53.74 
 
 		 282 aa  284  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  43.17 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  45.17 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  44.67 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  39.36 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  39.45 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  44.48 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  41.76 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  41.84 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  41.75 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  43.45 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  43.45 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  41.05 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  43.79 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  43.79 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  41.15 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  39.71 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  39.34 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  38.99 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  38.57 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  38.57 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.42 
 
 		 327 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.87 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.4 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  40.71 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.88 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.88 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.88 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.94 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  37.55 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  37.8 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.17 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  39.01 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  35.21 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.23 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  37.99 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  35.92 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  37.28 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  37.88 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  37.59 
 
 		 424 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  38.57 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  37.59 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  36.11 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  37.36 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  34.68 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  33.45 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  34.89 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  36.11 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  32.87 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  32.62 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 242 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  34.38 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  35.17 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  35 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  33.55 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  31.27 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  34.72 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  41.33 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  32.78 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  32.44 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  32.11 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  38.99 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  30.39 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.4 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  28.44 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  32.34 
 
 		 605 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  31.4 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  32.62 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  32.5 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.87 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  29.45 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  29.21 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  33.01 
 
 		 174 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  31.31 
 
 		 290 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  30.16 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  32.59 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  30.87 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  30.65 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  30.32 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.8 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  29.71 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  31.21 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  32.24 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  31.39 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  40.71 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  40.71 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  27.12 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  23.15 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  25.11 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0815  metallophosphoesterase  23.85 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.983977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  37.8 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1871  metallophosphoesterase  24 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>