103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0308 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  43.15 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  40.62 
 
 
277 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  40.62 
 
 
258 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  40.62 
 
 
258 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  37.4 
 
 
251 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  39.11 
 
 
242 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  40.4 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  39.93 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.94 
 
 
245 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  37.93 
 
 
259 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  35.55 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  37.45 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  35.66 
 
 
255 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  36.02 
 
 
259 aa  161  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  40.8 
 
 
247 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  40.71 
 
 
247 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  35.8 
 
 
255 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
282 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
424 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  34.63 
 
 
255 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
424 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  37.05 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  38.06 
 
 
262 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  34.89 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  34.07 
 
 
263 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  38.13 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  33.06 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  33.81 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  36.82 
 
 
276 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
276 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  34.85 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  33.95 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  34.96 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.95 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  33.83 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  34.32 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.88 
 
 
304 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  34.32 
 
 
275 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
262 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  31.6 
 
 
262 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  33.21 
 
 
268 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
264 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  33.08 
 
 
280 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  32.51 
 
 
282 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.1 
 
 
262 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  33.22 
 
 
316 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  34.65 
 
 
257 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
265 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  31.78 
 
 
270 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  32.49 
 
 
276 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
281 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
292 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  36.59 
 
 
174 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  36.08 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  29.62 
 
 
283 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  29.47 
 
 
311 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  32.2 
 
 
259 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  32.26 
 
 
278 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
262 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
284 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
299 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
251 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
282 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  26.14 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  32.94 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
282 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
339 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  29.28 
 
 
213 aa  89.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
283 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  28.75 
 
 
605 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.96 
 
 
327 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.13 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.96 
 
 
327 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.13 
 
 
327 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.96 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.96 
 
 
327 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  41.04 
 
 
158 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  41.04 
 
 
158 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  36.75 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  27.53 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.41 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  28.78 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1332  metallophosphoesterase  28.42 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  22.73 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0703  hypothetical protein  31.94 
 
 
77 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0493947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>