98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0018 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  76.45 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  56.94 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  55.06 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  43.98 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  41.24 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  37.86 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  39.78 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  37.93 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  39.02 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  39.46 
 
 		 242 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  36.84 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  37.41 
 
 		 424 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  35.21 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  37.41 
 
 		 424 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  36.76 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  38.66 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  38.66 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  34.96 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  37.55 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  33.83 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  40.23 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  36.06 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.4 
 
 		 245 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  33.71 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  36.86 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  33.21 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  37.75 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  36.73 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  37.72 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  33.09 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  35.06 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  35.07 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  33.73 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  36.86 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  34.62 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  32.7 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  30.92 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  32.06 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  38.06 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  35.38 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  31.96 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  37.25 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.8 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  33.69 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  34.75 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.55 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  32.4 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  31.03 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  30.54 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  32.4 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  33.2 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  31.23 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  33.08 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  36.16 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  32.35 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  32.92 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  34.78 
 
 		 174 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  33.07 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  34.57 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  32.47 
 
 		 605 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  31.31 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  30.07 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  34.7 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  34.41 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.56 
 
 		 304 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  32.56 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  35.07 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  34.7 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  25.44 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  28.04 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  38.04 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  28.49 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  39.52 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  25.93 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  25.93 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  36.43 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  36.43 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  24.5 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522505 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  26.46 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0703  hypothetical protein  40.58 
 
 		 77 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0493947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>