93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4759 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  51.48 
 
 
242 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44 
 
 
245 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  40.94 
 
 
279 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  44.83 
 
 
251 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  38.64 
 
 
247 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  39.01 
 
 
258 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  39.01 
 
 
258 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  38.64 
 
 
247 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  39.51 
 
 
277 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  37.85 
 
 
252 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  39.05 
 
 
255 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  36.59 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  36.22 
 
 
255 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  36.96 
 
 
258 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  34.95 
 
 
282 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  40.13 
 
 
261 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  35.09 
 
 
257 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  35.15 
 
 
266 aa  99  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
259 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  33.96 
 
 
262 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  33.01 
 
 
276 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  31.18 
 
 
255 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  34.08 
 
 
254 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  33.52 
 
 
311 aa  94.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  32.24 
 
 
424 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  31.68 
 
 
263 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
292 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  35.83 
 
 
268 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
424 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
259 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  34.76 
 
 
268 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
275 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  35.53 
 
 
276 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
268 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
275 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  33.7 
 
 
255 aa  88.2  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  35.4 
 
 
263 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  34.3 
 
 
280 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
276 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
270 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
276 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  30.57 
 
 
282 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  29.47 
 
 
281 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
276 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
276 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
284 aa  84.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  31.46 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.69 
 
 
262 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  33.92 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
316 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  32.34 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  29.27 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
282 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  29.51 
 
 
278 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  33.13 
 
 
262 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  33.72 
 
 
264 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  32.96 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  33.52 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  31.29 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.29 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  30.32 
 
 
262 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  28.42 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  27.08 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  30.16 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  28.42 
 
 
281 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  27.61 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.61 
 
 
262 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 
331 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 
327 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  36.54 
 
 
294 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 
327 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28 
 
 
304 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 
323 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 
327 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.71 
 
 
327 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
290 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
276 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  28.49 
 
 
251 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  28.12 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
283 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  24.74 
 
 
282 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
329 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
282 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  28.99 
 
 
254 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  23.2 
 
 
282 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  43.86 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  43.86 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  26.06 
 
 
294 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  28.67 
 
 
271 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
339 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>