98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1359 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  100 
 
 
259 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  76.45 
 
 
259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  58.72 
 
 
281 aa  301  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  52.99 
 
 
265 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  45.49 
 
 
255 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  40.36 
 
 
282 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  39.78 
 
 
255 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  40.15 
 
 
279 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  39.1 
 
 
255 aa  164  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  38.35 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
424 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
424 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  37.92 
 
 
252 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  39.85 
 
 
242 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
258 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
258 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  36.5 
 
 
254 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  36.8 
 
 
277 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  36.02 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  35.92 
 
 
276 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.98 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  35.61 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  35.23 
 
 
247 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  39.85 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
258 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  34.34 
 
 
254 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  32.52 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  37.86 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  33.22 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  37.86 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  34.45 
 
 
292 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  37.12 
 
 
251 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
262 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.75 
 
 
262 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  33.56 
 
 
282 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  35.04 
 
 
263 aa  121  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  35.53 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  36.05 
 
 
280 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.4 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.55 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  37.94 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  34.86 
 
 
276 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  33.1 
 
 
276 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
276 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  32 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  37.17 
 
 
290 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
268 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
262 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  30.88 
 
 
270 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  32.98 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  32.98 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
278 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  30.15 
 
 
265 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  36.33 
 
 
282 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  33.47 
 
 
605 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  34.57 
 
 
254 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  36.43 
 
 
283 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  34.57 
 
 
251 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  31.76 
 
 
338 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  34.52 
 
 
262 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  36.41 
 
 
294 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  35.69 
 
 
282 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  35.69 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.29 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  28.98 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
311 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  28.28 
 
 
339 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  34.38 
 
 
174 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  34.41 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  30.16 
 
 
213 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  32.2 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  39.88 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  24.43 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.05 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.05 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.05 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.05 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.05 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.05 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.05 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  38.71 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  39.47 
 
 
158 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  39.47 
 
 
158 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  26.43 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0703  hypothetical protein  42.03 
 
 
77 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0493947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>