91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1374 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  44.53 
 
 
605 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  33.46 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
259 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  31.33 
 
 
255 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  33.6 
 
 
247 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
424 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
255 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  34 
 
 
247 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
255 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  29.01 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
424 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  31.42 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  30.49 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  31.94 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  30.57 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.23 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  30.95 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  30.3 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
258 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
258 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
261 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  31.88 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  29.71 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  31.22 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  29.27 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  32.52 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  28.1 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  30.37 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  24.73 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.27 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  28.62 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.38 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.52 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  26.16 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  29.76 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  29.76 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  25.18 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  27.82 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  29.69 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
282 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  25 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  24.61 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
331 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.21 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  30.58 
 
 
158 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  30.58 
 
 
158 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  28.9 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2872  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2606  metallophosphoesterase  33.6 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>