97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3446 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  100 
 
 
282 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  98.58 
 
 
282 aa  550  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  91.84 
 
 
282 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  73.57 
 
 
283 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  69.15 
 
 
290 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  70.92 
 
 
294 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  37.15 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  33.57 
 
 
252 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  34.01 
 
 
258 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  35.69 
 
 
259 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  36.46 
 
 
254 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  32.75 
 
 
276 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
262 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  34.67 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  33.96 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  35.07 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  31.96 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  31.96 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  32.11 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  32.41 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  33.87 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  31.37 
 
 
261 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  33.91 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  31.1 
 
 
268 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  30.6 
 
 
253 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  32.63 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  32.28 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
266 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  31.69 
 
 
268 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  32.3 
 
 
424 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  31.21 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.86 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
424 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  31.16 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  34.42 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  30.74 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  31.8 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  31.16 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  32.05 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  30.8 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  32.33 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  28.98 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  27.01 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  31.78 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  31.97 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  32.63 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.47 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  28.94 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  24.46 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  32.66 
 
 
605 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.16 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  24.46 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.91 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  36.29 
 
 
158 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  36.29 
 
 
158 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  24.28 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  28.57 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.99 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  24.73 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  33.09 
 
 
174 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.22 
 
 
323 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.51 
 
 
331 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.22 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.22 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.22 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.22 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.22 
 
 
327 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  24.23 
 
 
174 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  26.42 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0959  metallophosphoesterase  41.1 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0590877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>