92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4241 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  100 
 
 
174 aa  356  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  60.48 
 
 
254 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  52 
 
 
294 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  46.06 
 
 
424 aa  140  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  45.45 
 
 
424 aa  140  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  48.19 
 
 
257 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  37.06 
 
 
252 aa  98.2  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  39.88 
 
 
259 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  37.13 
 
 
253 aa  94.4  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  38.04 
 
 
259 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  37.35 
 
 
247 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  40 
 
 
281 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  37.35 
 
 
247 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
265 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  36.78 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  44.95 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  38.24 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  38.24 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  34.48 
 
 
262 aa  77.8  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  35.12 
 
 
277 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
255 aa  77.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  42.03 
 
 
251 aa  77.8  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  39.17 
 
 
266 aa  77.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  33.13 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  35.93 
 
 
255 aa  74.7  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  41.13 
 
 
276 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  35.43 
 
 
339 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  31.64 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  31.07 
 
 
265 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
242 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.38 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  34.33 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  34.43 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  30.18 
 
 
258 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  34.29 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
268 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  32.57 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  32.24 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  29.9 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  32.4 
 
 
276 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
311 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  34.17 
 
 
299 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
292 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
331 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
283 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  33.15 
 
 
276 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
327 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
323 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.86 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  33.15 
 
 
276 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
290 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
284 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  37.01 
 
 
282 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
278 aa  62  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
281 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  34.71 
 
 
281 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  33.9 
 
 
275 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  41.03 
 
 
251 aa  61.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  36.22 
 
 
282 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  33.9 
 
 
275 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  35.07 
 
 
282 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  32.75 
 
 
338 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.17 
 
 
327 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  40.62 
 
 
294 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  32.24 
 
 
276 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
338 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  37.01 
 
 
283 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  32.09 
 
 
259 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.78 
 
 
304 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
329 aa  55.1  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  25.63 
 
 
277 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
263 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  30.67 
 
 
605 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  32.4 
 
 
328 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  29.81 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.84 
 
 
262 aa  49.3  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1149  metallophosphoesterase  62.07 
 
 
68 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2768  metallophosphoesterase  40.24 
 
 
240 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5533  metallophosphoesterase  32.91 
 
 
246 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>