95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0059 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  100 
 
 		 329 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  58.13 
 
 		 278 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  55.86 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  54.69 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  54.69 
 
 		 281 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  54.37 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  54.69 
 
 		 268 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  52.96 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  52.62 
 
 		 311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  37.07 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  34.46 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  33.64 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  33.64 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  33.63 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  33.63 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  32 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  33.54 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  32.72 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  29.64 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  32.52 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  30.65 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  33.04 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  32.83 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  32.83 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  31.71 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  31.82 
 
 		 258 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.06 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  32.24 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  31.85 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  31.29 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  30.7 
 
 		 252 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  29.39 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.39 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.29 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.01 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  32.18 
 
 		 254 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  28.25 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  30.27 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  29.94 
 
 		 261 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  30.7 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  30.37 
 
 		 424 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  30.37 
 
 		 424 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  29.94 
 
 		 254 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  26.9 
 
 		 264 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  29.75 
 
 		 253 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  44.76 
 
 		 247 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  45.71 
 
 		 247 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  28.32 
 
 		 282 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  28.53 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  33.02 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  42.59 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  26.14 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  31.99 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  27.6 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  28.61 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  30.22 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  25.22 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  28.61 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  24.43 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  24.36 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  29.17 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  29.34 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.54 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  30.06 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  37.19 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  37.19 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  26.71 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  28.79 
 
 		 605 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  31.79 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  29.12 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.72 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  25.67 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  26.36 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  23.74 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  26.13 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  29.7 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  26.27 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  32.99 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  40 
 
 		 174 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  30.93 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  23.72 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>