86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1933 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
262 aa  547  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  84.29 
 
 
262 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  82.76 
 
 
262 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  81.99 
 
 
262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  69.73 
 
 
262 aa  391  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.32 
 
 
262 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
263 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  31.48 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.84 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  30.55 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  32.37 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  30.55 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
279 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  32.73 
 
 
255 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
261 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  30.62 
 
 
255 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  30.26 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  31 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  31.37 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  31.37 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  32.82 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  30.53 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
282 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  29.1 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
277 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  30.04 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  28.41 
 
 
276 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
258 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
258 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  30.11 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
276 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  28.19 
 
 
251 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  25.68 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  28.42 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  24.66 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.38 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  29.28 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  24.51 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  25.34 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  25.89 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  26.45 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  27.61 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  26.77 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.11 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  29.83 
 
 
605 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  26.76 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  23.05 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  24.45 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  26.21 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  22.97 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  25.86 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  23.36 
 
 
282 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  32.22 
 
 
339 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  24.51 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  28.08 
 
 
158 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  28.08 
 
 
158 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  23.66 
 
 
311 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>