99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4143 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1202    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  44.53 
 
 
262 aa  203  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  34.48 
 
 
282 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
279 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  33.61 
 
 
259 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
276 aa  104  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  31.27 
 
 
247 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  30.18 
 
 
247 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  29 
 
 
264 aa  97.8  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
258 aa  97.4  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  32.47 
 
 
259 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  35.15 
 
 
424 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  33.6 
 
 
268 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  34.31 
 
 
424 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
261 aa  94.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
262 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  38.35 
 
 
257 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  31.09 
 
 
255 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  31.05 
 
 
277 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  34.75 
 
 
276 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  30.04 
 
 
270 aa  91.3  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  29.54 
 
 
265 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
268 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  35.61 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  31.33 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  31.73 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  30 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
258 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
258 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  31.28 
 
 
254 aa  84  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  29.89 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  35.23 
 
 
275 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
265 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  29.72 
 
 
251 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  35.65 
 
 
276 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  35.65 
 
 
276 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  27.84 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
276 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  34.35 
 
 
276 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  34.06 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
284 aa  79  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  32.77 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  33.84 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  28.75 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.68 
 
 
262 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  27.55 
 
 
282 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.51 
 
 
245 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
242 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
263 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  28 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
262 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  27.08 
 
 
174 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
277 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.43 
 
 
262 aa  72  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  26.23 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  28.68 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  28.99 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  33.8 
 
 
283 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
294 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  28.96 
 
 
278 aa  65.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
282 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
283 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
282 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  27.39 
 
 
311 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.83 
 
 
262 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
299 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
282 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  27.3 
 
 
270 aa  60.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3470  hypothetical protein  46.48 
 
 
115 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.771086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
316 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.41 
 
 
304 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.16 
 
 
323 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  23.08 
 
 
213 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  44.59 
 
 
433 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  31.25 
 
 
259 aa  54.7  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2367  hypothetical protein  39.58 
 
 
114 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259814  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.7 
 
 
331 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.7 
 
 
327 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.7 
 
 
327 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.7 
 
 
327 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.7 
 
 
327 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.7 
 
 
327 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  32.37 
 
 
294 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  27.82 
 
 
329 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0723  hypothetical protein  46.97 
 
 
110 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.623944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  33.59 
 
 
174 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3814  hypothetical protein  40.79 
 
 
102 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.421046  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
339 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  26.51 
 
 
254 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  32.67 
 
 
158 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  32.67 
 
 
158 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
251 aa  44.3  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  28.87 
 
 
338 aa  43.9  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>