14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3470 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3470  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2367  hypothetical protein  65.77 
 
 		 114 aa  158  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5672  hypothetical protein  44.83 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  49.25 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  46.48 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0986  hypothetical protein  38.3 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.776274  normal  0.0220899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1155  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5709  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3838  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4065  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2595  hypothetical protein  42.7 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0347334  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0702  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3062  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3780  hypothetical protein  38.78 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>