16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4065 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4065  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5709  hypothetical protein  93.85 
 
 		 325 aa  564  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5672  hypothetical protein  37.22 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2595  hypothetical protein  33.51 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0347334  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1977  hypothetical protein  44.58 
 
 		 120 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3838  hypothetical protein  41.46 
 
 		 103 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0986  hypothetical protein  43.59 
 
 		 120 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.776274  normal  0.0220899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1155  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3470  hypothetical protein  37.65 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2367  hypothetical protein  38.82 
 
 		 114 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  41.11 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3062  hypothetical protein  37.23 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0702  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3780  hypothetical protein  43.33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2121  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0445679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2271  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>