11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3062 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3780  hypothetical protein  47.62 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  51.52 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2367  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3470  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4065  hypothetical protein  37.23 
 
 		 325 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5709  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3838  hypothetical protein  37.25 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5672  hypothetical protein  40.22 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1977  hypothetical protein  47.92 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  40.58 
 
 		 605 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>