16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3838 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0986  hypothetical protein  67.65 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.776274  normal  0.0220899 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5672  hypothetical protein  42.68 
 
 		 337 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1155  hypothetical protein  45.88 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0702  hypothetical protein  42.35 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  44.16 
 
 		 433 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4065  hypothetical protein  41.46 
 
 		 325 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5709  hypothetical protein  41.46 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2367  hypothetical protein  42.68 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3470  hypothetical protein  38.2 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3814  hypothetical protein  36.59 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.421046  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1977  hypothetical protein  35.63 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3062  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0445679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2595  hypothetical protein  34.44 
 
 		 357 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0347334  normal  0.662589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>