112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4142 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  100 
 
 
258 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  62.2 
 
 
255 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  61.81 
 
 
255 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  49.41 
 
 
254 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
279 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  46.42 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  43.64 
 
 
282 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  40.61 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  44.81 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
275 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.57 
 
 
245 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  43.17 
 
 
276 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  42.96 
 
 
280 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  42.05 
 
 
258 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  42.05 
 
 
258 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  42.8 
 
 
277 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  44.81 
 
 
268 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  42.96 
 
 
276 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  41.38 
 
 
252 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  43.73 
 
 
276 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  43.73 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  43.73 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  42.81 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.58 
 
 
304 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  40.96 
 
 
247 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  42.86 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  43.23 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  40.89 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  40.08 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  41.26 
 
 
262 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  37.23 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  36.93 
 
 
292 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  40 
 
 
254 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  36.88 
 
 
282 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  35.55 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
424 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  38.43 
 
 
255 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  38.64 
 
 
424 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  34.32 
 
 
264 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  39.62 
 
 
257 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
259 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  37.7 
 
 
263 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  33.09 
 
 
265 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  33.45 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.44 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.24 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.24 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.24 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  36.03 
 
 
270 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  35.94 
 
 
242 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
259 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  33.92 
 
 
277 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  34.26 
 
 
281 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  34.26 
 
 
281 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  32.52 
 
 
311 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  32.37 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  33.57 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
284 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  36.33 
 
 
259 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  32.85 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  35.09 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.2 
 
 
262 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50 
 
 
327 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  36.96 
 
 
174 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  49.59 
 
 
331 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  49.59 
 
 
327 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.47 
 
 
262 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  33.11 
 
 
282 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  35.45 
 
 
254 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
282 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  32.09 
 
 
262 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  29.97 
 
 
329 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  32.53 
 
 
290 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  33 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  32.48 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  32.68 
 
 
605 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  35.86 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.13 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  32.53 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  26.63 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  31.31 
 
 
339 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  35.51 
 
 
158 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  35.51 
 
 
158 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
328 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10093  Ser/Thr protein phosphatase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_1G14840)  26.99 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  31.25 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
338 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0497  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
338 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1725  metallophosphoesterase  26.35 
 
 
328 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2865  metallophosphoesterase  23.58 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0711307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>