23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0059 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  51.47 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  41.09 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  41.09 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  32.32 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  37.19 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  32.82 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  28.06 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  28.06 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  36.09 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  28.57 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  28.57 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  28.89 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  28.89 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  28.89 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  28.89 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  25.59 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  27.18 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  21.88 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  27.97 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  23.89 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  23.89 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  23.35 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>