30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0201 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  100 
 
 		 223 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  50.23 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  50.23 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  51.47 
 
 		 206 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  34.55 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  35.65 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  34.72 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  34.26 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  34.65 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  34.65 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  33.03 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  32.58 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  32.55 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  32.55 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  32.55 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  32.55 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  38.06 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  33.17 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  24.89 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  26.19 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  26.19 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  24.52 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  30.65 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  30.06 
 
 		 907 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  22.94 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  26.17 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  26.7 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  34.38 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  28.86 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.71 
 
 		 886 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>