35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1581 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  82.33 
 
 		 215 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  82.33 
 
 		 215 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  79.07 
 
 		 215 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  78.14 
 
 		 215 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  41.43 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  50.34 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  37.56 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  35.27 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  36.27 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  36.27 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  33.17 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  25.64 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  25.64 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  27.18 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  30.2 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  30.2 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  30.2 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  30.2 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  27.54 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  25.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  28.06 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  25.25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  28.34 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  28.34 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  26.87 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1632  hypothetical protein  29.03 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  27.17 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  26.5 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  27.4 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  23.48 
 
 		 886 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  26.26 
 
 		 255 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4719  hypothetical protein  24.88 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.102384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>