26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4424 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  40.83 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  35.02 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  35.02 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  32.76 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  30.73 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5728  hypothetical protein  46 
 
 		 137 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.046672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  28.86 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  34.78 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05440  hypothetical protein  50.88 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  25.47 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  26.79 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  31.5 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  25.53 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  25.47 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  26.98 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  20 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  20 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  24.66 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  30.14 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>