36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1345 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  34.86 
 
 		 220 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  32.55 
 
 		 223 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  36.94 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  32.34 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  28.89 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  28.64 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  28.64 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  32.24 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  32.24 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  29.8 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  24.62 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  24.62 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  34.56 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  31.48 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  29.28 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  25.43 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  30.2 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  33.14 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  31.02 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  30.05 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  28.33 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  27.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  31.58 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1860  hypothetical protein  29.93 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  32.41 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  25.15 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  26.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  27.06 
 
 		 206 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>