20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2178 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  29.32 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  29.91 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  25.93 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  34 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  25.79 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1632  hypothetical protein  28.16 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  27.13 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  27.71 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4719  hypothetical protein  25.59 
 
 
256 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.102384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  27.03 
 
 
219 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  27.06 
 
 
205 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  27.06 
 
 
205 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  27.06 
 
 
205 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  27.06 
 
 
205 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>