44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01456 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  41.24 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  42.78 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  40.44 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  32.82 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  28.71 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  36.28 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  36.28 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  29.91 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  29.38 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  32.22 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  27.31 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  27.31 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3149  hypothetical protein  27.04 
 
 		 335 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  26.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5219  hypothetical protein  27.04 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  27.92 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5053  hypothetical protein  27.04 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.734373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06968  hypothetical protein  30.65 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  28.35 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  28.35 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  26.83 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  26.83 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  24.84 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  30.36 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  27.97 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1632  hypothetical protein  27.01 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  27.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1425  hypothetical protein  26.74 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  28.86 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  28.81 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0015  hypothetical protein  25.55 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  29.52 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  26.82 
 
 		 794 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>