32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2601 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  27.47 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  34.94 
 
 		 229 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  29.89 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  28.3 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  37.38 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  28.3 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  29.73 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  29.35 
 
 		 214 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  31.35 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  31.35 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  31.35 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  28.35 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5219  hypothetical protein  27.41 
 
 		 367 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5053  hypothetical protein  27.41 
 
 		 367 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.734373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3149  hypothetical protein  27.41 
 
 		 335 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  26.84 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  26.84 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  27.2 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  27.71 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  33.04 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  26.79 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  34.57 
 
 		 255 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  24.19 
 
 		 210 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1193  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  normal  0.38143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>