24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0007 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  28.23 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  26.92 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  25.29 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  28.65 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  31.11 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  30.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  37.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  37.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  31.35 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0015  hypothetical protein  25.85 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  27.18 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  27.18 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  27.18 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  27.18 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  25.81 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  31.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  30.19 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  26.54 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  27.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  29.17 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>