17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4201 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  92.82 
 
 
209 aa  391  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  41.24 
 
 
208 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  36.71 
 
 
206 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  30.24 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  37.3 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  21.58 
 
 
219 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  28.33 
 
 
205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  28.33 
 
 
205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  28.33 
 
 
205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  28.33 
 
 
205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06968  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  28.35 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  23.08 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  27.13 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  22.4 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  22.4 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>