25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0494 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  39.37 
 
 		 235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  34.72 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  37.56 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  34.21 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  34.2 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5728  hypothetical protein  47.96 
 
 		 137 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.046672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  34.21 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  32.45 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  37.38 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  23.14 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  23.14 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05440  hypothetical protein  49.18 
 
 		 62 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  33.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4354  hypothetical protein  34.95 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  34.38 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  31.36 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  28.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>